離子交換層析是發展較早的層析技術之一。目前，離子交換層析已成為蛋白質分離純化中常用的手段，統計顯示，在蛋白質的純化方案中,使用到離子交換層析的占75%，其次是使用親和層析和凝膠過濾層析。但同時離子交換層析在除蛋白質以外物質(如多糖、核酸)的分離純化中也得到了一定的應用。
 

　　由于殼聚糖脫乙酰度和相對分子質量是與殼聚糖應用相關的重要參數，在溶液中殼聚糖分子上帶有正電荷的量與殼聚糖的脫乙酰度有關，而離子交換層析色譜是根據被分離分子的電荷差異來進行分離的，為此，通過研究離子交換層析色譜分離殼聚糖的方法，以期分離出分子鏈上含有不同電荷量的殼聚糖，即分離出不同脫乙酰度的殼聚糖組分。

　　離子交換層析色譜法用于菊花中新多糖的提?。?/span>

　　通過熱水提取、離子交換層析和凝膠層析，從菊花中分離得到一個新的多糖。具體的分離提純步驟為：4.5kg 菊花經95%脫脂，接著用100L 熱水萃取(3×5h)，得粗多糖378g;10g粗多糖去除蛋白，然后采用纖維素柱用水洗提;洗出液需透析;滲析液經凝膠滲透色譜純化。

　　離子交換層析法在多糖分離提純上有著廣泛的應用。目前已有較多相關報導，例如在低聚木糖，低聚果糖，枸杞多糖，海帶多糖，龍須菜多糖，紫芝多糖等分離提純的步驟中均用到離子交換層析法，并達到了各自要求的分離提純效果。

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